近日，深圳市税务局向多家国际货运代理企业发出税务核查通知，要求围绕“国际货物运输代理服务”免税发票开展自查。重点针对2025年8月至2026年3月期间的开票及申报数据，要求相关企业在4月3日前完成自查与更正申报，对误享免税的收入进行补税处理。
国际货代行业长期享有的“免增值税”优惠，本质上属于跨境应税行为的特殊税收安排，但该政策适用范围一直存在严格边界：
仅“直接提供国际货物运输代理服务”的收入可适用免税，而报关、仓储、装卸搬运等配套服务并不在免征增值税的范围之内，若单独核算，通常需按约6%税率缴纳增值税 。
但长期以来，由于国际货代业务链条长、收费项目复杂，不少货代企业习惯将报关、仓储、国内运输等配套服务收入打包计入国际货代收入，一并享受免税政策。此次深圳税务核查，就是对这一模糊地带进行针对性清理。
从通知内容看，本轮税务核查主要围绕以下三个方面：
① 物流配套服务不能混进免税票里
税务部门明确强调，代理报关服务、装卸搬运服务、仓储服务等，属于物流辅助服务或商务辅助服务，不在“国际货物运输代理服务”免征增值税的范围内，需按6%的服务费税率或9%的运输税率正常纳税。
② 资金结算必须通过金融机构结算
国际货代服务收入，以及向国际运输承运人支付的国际运输费用，必须通过金融机构结算，同时合同、运输单据、付款凭证等资料需完整留存备查，否则将影响免税资格认定 。
③ 免税业务和应税业务必须分别核算
同时经营免税项目和应税项目的企业，必须分别核算不同业务的销售额，没有单独核算的，不得享受免税、减税待遇。
此次深圳对货代税务核查并非孤立事件，自2025年以来，全国针对跨境应税行为的税务合规要求逐步强化，从卖家端的隐匿收入稽查，到报关端的“买单报关”打击，再到物流端的免税发票核查，监管已覆盖“货、款、物流”全链条，跨境电商财税合规已是大势所趋。
对所有货代企业而言，唯有主动适应监管要求，筑牢合规根基，才能在行业洗牌中站稳脚跟，抓住跨境电商发展的新机遇。
对跨境卖家而言，选择合规货代比选便宜货代更重要，因为今天省下来的物流成本，明天可能就是巨额的补税、罚款和货物损失。
