特殊综合保税区、保税物流园区是在我国更深层次、更宽领域、更大力度对外开放中设立的海关特殊监管区域，均具有“关外境内”的特点。但是两个区域各有不同的优势，下面我们就来分析一下吧！
特殊综保区以“守住安全、高效管住为底线，取消不必要的贸易监管、许可和程序要求，实施更高水平的贸易自由化便利化政策和制度”为原则，在制度层面上“最大限度简化‘一线’申报制度，突出区内经营自由，严格‘二线’监管，改革海关统计方法”。
具体来看，在申报模式上，除法律法规要求必须进行申报的外，“一线”对于不涉证、不涉检的货物，采用径行提货、发货模式；“二线”由以往区内外企业双侧申报制度改为区外企业单侧申报制度。
在贸易管制上，除涉及国际公约、条约、协定或涉及安全准入管理的货物，确需在“一线”验核监管证件外，其余在“二线”验核。对依法实施检疫的货物，原则上在口岸完成；对入境检验的货物，原则上在“二线”实施。对涉证涉检货物在“一线”或“二线”只验核一次，不重复验核。
而在区内管理方面，海关取消账册管理，不要求区内企业单独设立海关账册，免于手册核销、单耗管理等海关常规监管，对区内企业实行企业自律管理，海关不干预企业正常经营活动。
保税物流园区
保税物流园区是保税园区的升级版本实行保税区的政策，以发展仓储和物流产业为主，按“境内关外”定位，海关实行封闭管理的特殊监管区域。
保税物流园区可以促进国际中转。即对国际、国内货物在园区内进行分拆、集拼后，转运至境内外其他目的港。国际中转是世界各大自由港的主体功能，也是航运中心实力的体现。
国际配送业务也是保税物流园区的重头戏。对进口货物进行分拣、分配或进行简单的临港增值加工后，向国内外配送。国际配送为保税物流园区发展增值服务创造了一个重要平台。
保税物流园区有利于开展国际采购。对采购的国际货物和进口货物进行综合处理和简单的临港增值加工后，向国内外销售。
经过保税物流园区的国际转口贸易更加便捷。进口货物在园区内存储后不经加工即采取转口贸易方式直接出口到其他国家和地区。
具体来说，国内货物进入物流园区视同出口；出口报关完成即可打印退税联；出境备案仅需一次；出口报关仅需一次；企业自用设备用品免受产品认证；集装箱允许拆箱，即可以整进散出而无需整进整出。
1.区内加工制造企业可利用剩余产能承接境内区外委托加工。2.区内实施企业自主备案、合理自定核销周期、自主核报、自主补缴税款并简化海关业务核准手续。3.区内新设的研发设计、加工制造企业，经评定符合有关标准的，直接赋予最高信用等级。4.除禁止进境的外，区内企业从境外进口且在区内用于研发的货物、物品，免于提交许可证件，进口的消耗性材料根据实际研发耗用核销。5.对境内入区的不涉出口关税、不涉贸易管制证件、不要求退税且不纳入海关统计的货物、物品，实施便捷进出区管理模式。6.区内实行数据自动比对、卡口自动核放，保税货物点对点直接流转。7.区内企业进口的医疗器械用于研发、展示的，可不办理相关注册或备案手续。8.文物自境外入区实施入区登记审核。艺术品在综合保税区与境外之间进出的，免办文化和旅游行政部门批准文件。9.区内企业从境外进口已获批的人用疫苗或体外诊断试剂，可在具备必要监管查验条件的综合保税区内查验。境外入区的食品，如需检测的，在抽样后即放行，对境外入区动植物产品的检验项目，实行“先入区、后检测”，根据检测结果进行后续处置。10.对注册在综合保税区内的融资租赁企业进出口飞机、船舶和海洋工程结构物等大型设备，不具备实际入区条件的，可实行海关异地委托监管。11.经海关核准，区内企业可以办理集中申报手续。实行集中申报的区内企业在海关规定的期限内对申报清单数据进行归并后向海关办理集中申报手续。集中申报适用报关单集中申报之日实施的税率、汇率。12.满足海关监管条件的前提下，允许非保税货物以非报关方式进入综合保税区，与保税货物集拼、分拨后，实际离境出口或出区返回境内。
（整理自12360海关热线）
从功能上看，综合保税区是集保税、加工、展示、物流为一体的特殊关税区域；而保税物流园区更强调商品中转流通的物流功能，较少加工设施；特殊综合保税区则是比保税区更加便利化的最新自贸试点区域。
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